總行設職能部門14個，其中前臺部門4個，分別為小微業務部（與鄉村振興一部合署辦公）、普惠業務部（與鄉村振興二部合署辦公）、特殊資產經營管理部、總行營業部；中臺部門6個，分別為授信管理部、風險管理部、合規管理部、財務會計部、網絡金融部、內部審計部；后臺部門4個，分別為董（監）事會辦公室、綜合辦公室（與團委辦公室、工會辦公室、安全保衛部、消費者權益保護辦公室合署辦公）、人力資源部（與黨委組織部、黨委辦公室、黨委宣傳部、黨委統戰部合署辦公）、紀委辦公室（與監察室合署辦公）。